化学书上说“原子在化学反应中不可分”好像不对啊？

你对这个理解有错误。
虽然原子由原子核和电子组成，但一个原子是否变成了另一种原元素的原子，取决于其原子核是否变化，而与电子转移无关。当核外电子转移后，原子核没有变化，该原子仍是同一原子。此句话中“原子不可分”，是针对“一个或几个原子分裂或合成新的原子”而言的。
所谓的原子被分开，是指原子中的质子和中子发生了转移，产生了新的元素的原子，而这个质子和中子的转移属于核物理反应范畴，不属于化学反应了。

这句话确实有欠考虑.
书上指原子结构.就是说只要原子核不可分就认为是原子结构不可分.化学反应中原子结构不可分是正确的.
你将书上的原子理解为"原子结构"或者原子核就对了.

的确没有分开!化学变化中形成的化学键都是公用电子的情况

除那些可能失去全部最外层电子的元素H，Li等来说都可以认为这句话没有问题。楼上说都是形成共用电子的兄弟那离子键怎么办哪？

它的意思是,在化学反应中,原子核是不可分的，而电子是要分开的。

是初中的教材 到高中就错了