按规定个人部分的失业保险不需要个人支付，但却每月从工资里扣款,现在要把钱返回该员工,如何处理?

法律确实规定失业保险是单位交的。
你可以去劳动局的信访办公室或者是监察大队去告你公司，这样劳动局就会有人出面跟你公司交涉的。
如果调解不成，你可以申请劳动仲裁，费用也不高，最多不超过60块钱。
我不知道你说的做这分录是什么意思，如果需要回答，请补充问题，谢谢。