水电站竣工验收程序若何，项目法人向哪个部门申请竣工验收

当然是甲方了，也就是业主。你没签合同啊，合同上说的很清楚，还有国家水利水电规范。自己去查啊

根据国家发展改革委办公厅关于水电站基本建设工程验收管理有关事项的通知（发改办能源〔2003〕1311号）要求；
工程竣工验收由工程建设的审批部门负责。