那也就是说预缴时的所得税是按照会计制度算出来的

可以这样理解。因为：
所得税法是基于财务通则为基础的，只是考虑国家收入问题，无法完全按财务通则来做。
季度只是预缴。
汇算清缴才是正真缴纳。

可以这么理解，但也可以在预缴时，按税收有关规定调整的。