想把商店门市升级变更为小规模公司办理流程是什么？

根据你的叙述似乎你的小店当时是以个体户性质注册营业执照的，那么你必须注销个体户营业执照，注册新的有限公司营业执照，具体流程：到工商局查名，核准以后到银行开公司投资存款户头，请银行或会计师事务所出具验资报告，到工商局办理注册具体事宜，提供公司章程，股东名单，股份登记表，取得营业执照以后，到税务局办理税务登记证

换个名字就行
再就是办理申请一般纳税人或者小规模纳税人
办理的时候还是有点烦琐的
呵呵
我是做会计的
有好多的公司都再申请
只要你是一般纳税人或着小规模纳税人就可以做账和纳税申报了
呵呵