证人可以提出管辖权异议吗？

不可以呗
管辖异议是诉讼当事人的权利.诉讼当事人包括原告、被告和第三人。
证人是诉讼参加人。诉讼参加人还包括鉴定人、代理人

反诉是针对本诉而言的，既然是证人，根本不是当事人，是无权提起反诉的，所以当然也谈不上什么提起管辖异议。

如果对原告或被告有诉求，另行提起诉讼。

提出反诉后就有两从关系了。相当于两个诉讼，原诉中证人地位不变，在反诉中就是被告地位嘛。此时当然有权提出管辖权异议了。