我是应届毕业生，与一公司签就业协议书并注明违约金1000，试用期没到前我想辞职但公司要我付违约金。

你就不辞职就是了啊。弟弟一般上班，都不需要交钱的。特别是违约金这些都是不合法的。你上当了哦。

而且你开始因该问清楚违约金包括那些内容，为什么要交，又好久退还这些啊。

那个就业协议就是毕业前的 毕业后没用的

你想问的是：如果你不跟他们解除协议，对你以后的工作和档案有影响吗？
那么我想问问你，如果你不跟公司解除意违约金。给他就是啦，因为那是双方在签就业协议时定的，说白了就是公司对你的约束。
就像有些公司会因为你做兼职而把你开除并且会处以违约金，当然这些条件都是在（合同中）体现出来的。（你不要告诉我你没有看合同啊~！）
***既然你签了合同，那么双方都有履行合同的义务和责任。
现在这个社会呢，很现实的，知道什么叫能力吗~~！现在及以后的工作都是靠你自己来做的，当然做是不够的，公司要的是做到最好~~~！注：公司只是会看你档案里面你的工作简历，工作职位，接过的案子，成绩如何等等。除非你无能无才公司才会拒绝你的。
下一个问题，只要是年满18周岁的法定公民都有自主权。自主权上学学习过吧？

明白了吗~~~！呵呵有些笼统，觉得有帮助就参考下啦~~！经验之谈！