既然净空大师认为佛教不是宗教，那么他是有神论者还是无神论者呢？

这只能算是他的心识，不过这样认为并不足以说明他是不是有神论者。宗教、教育或哲学，都有可能是迷信的，取决于那个人自己怎样理解佛学，不一定是迷信的，也不排除是迷信的。
是的，有神论者都是迷信，虽然他们的学识心智可能在科学哲学博士以上，但他们认为世界运动由一个或多个永在的神（非物质状态）主宰，这是他们迷信的结果。佛的思想认为世界运动是由于事物本身与外界的交流、发生反应。可是，如果有人认为阿弥陀佛的世界是人死后去的，这也是迷信，因为精神世界只能在人生前达到。所以，迷信是一种被新世纪现代社会抛弃的、旧有的教育手段或哲学，除了宗教的形式之外的一种手段。
一个法师有没有水平，就看他能从他的信仰里挖出多少迷信的元素，然后把它们转化为新的形式来教育人民，比如用科学论著的形式，象《五蕴心理学》之类。

楼主的理解有误！！！
1，楼主理解的神，只不过是六道里面轮回的众生罢了，没什么值得信仰和崇拜的，尽然是六道轮回的众生，在佛教里就没有突出强调神啊、鬼啊，都是一视同仁，要救度他们出离轮回苦海；
2，究竟讲佛教是生命科学，是教育众生怎样获得解脱自在的生命科学，所以说佛教是教育，而不是宗教；
3，佛教里不讲究个人崇拜，因为人人具有佛性，人人都可以成佛，释迦牟尼佛祖只不过是先行一步了，呵呵。我们沿着前贤的足迹一样可以达到前贤的觉悟和成就。
楼主朋友，路在脚下，努力精进吧！

佛教之唯识学广博精微，具有极强的系统性、逻辑性，为了保持这种逻辑的理性，其倡导因明学的研究（相当于希腊的逻辑学）。这里决绝一切戏论，更没有玄化的成分，是任何人可以通解的学问，因为它的建立完全是科学的归纳与演绎方法，否定一切超越人伦的不可知成分（形而上）。只是唯识学名相较多，需要依照层次来学习，就好像心理学一样，里面使用了很多定义的概念，希望你有耐心，也希望你有这个智慧。首先要全面了解它，没有必要一定要相信什么，然后我们才有做出判定的客观性。

唯识学上的唯识义http://www.jiqun.com/dispfile.php?id=135