工伤补偿问题.

因工伤住院的，住院期间应当停工留薪，由企业按照医院出具的证明支付工资，待遇保持不变。如果你平时的工资为1000，那么住院期间的工资也应当是1000，与公司的运营利润没有关系。
至于住院时间的长短需要根据病情来决定，需要看医院的态度，根据医院出具的医疗证明。

和公司运营利润没关系。停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位支付。停工留薪期一般不超过12个月。你的工资是1000元减去应交的社会各种保险，剩下的就是你的发工资。