字句难点，急

按语文的角度来说这个变更是包括了两个的，因为地基基础费用和土石方费用在这句话里是连成一体的，也就是说这两个项目已经并在一起当作一个项目施工总价包干，不再作其他计量计价。
如果你是作为施工方，这个还是可以跟业主方争取的。。呵呵，，工程上的一些事你应该知道。

按语句常理,包括变更是指:地基基础费用及土石方费用;

但如果在这出现的话,可能存在歧异,你可以重新把这句话在合同中改一下,以肯定的语气说出来,如果已签订,你就追加款项或是加合同附属,万事小心!

以我拙见，应该是一起的
我是根据我学英语的语法来分析的
一般来说，及、和之类的并列字词是两者或两者以上都包括：
或者之类的选择性词句则是靠近原则，如:地基基础费用或土石方费用（包括变更） 其中变更的是土石方费用

仅供参考，我觉得，这么重要的合同应该找专人分析的，而不是在这里面发帖

“地基基础费用及土石方费用（包括变更）总价包干”意思是说不管是不变更还是变更都是那么多钱，包括两项，因为总价已包干包死了。
此条款对出包方有利，承包方不利。
记住：变更不是增加，减一加一，量不变；不能减一加二，那对承包方不公平。还是重新确认一下好。
可以能和发包方在这个问题上争取一下，关键是发包方它不干不愿意就不好办了。

按语句常理,包括变更是指:地基基础费用及土石方费用