めずらしく热心に本を読 んでいるので,えらいなあと思ったが,よく见ると漫画だった

难得看到他专心地看书，还觉着他不错呢，仔细一看他看的是漫画书。
めずらしい＝难得
热心＝专心，热衷
本=书
読 んでいる=正在读
えらい=了不起，不错，高贵，里海
なあ=感叹
思った=想
が=转折
よく=仔细
见る=看
漫画=漫画

很少有这么热忱地看书的时候呢，觉得（你或他或她）很不错呢，我一看原来是漫画啊~~~~

めずらしく（很少见）热心に（热忱地）本（书）を読（读） んでいる“ので”(表原因),えらい（原意“了不起”，这里就是说觉得他在看书很意外的意思）なあと思った（认为）が,よく见（看）ると漫画（漫画）だった

OK？