我用C盘的WINDOWS文件夹对应用程序进行扫描病毒时，卡巴斯基说进木马了。

请在安全模式下杀毒
因为普通模式，病毒已经加载于内存
安全模式杀毒后，运行msconfig，删除不启动的项目再重启。
建议你用ewido，不错。

没有全面杀！你杀了这个，但另外的没有处理掉，当然又会交叉感染啦。
用卡巴斯基6.0升级到最新病毒库后进入安全模式全面查杀一遍。