这是民事纠纷吗？该怎么处理？

可通过民事诉讼解决
属于名誉权侵害纠纷
重要的是你的朋友必须列出他在当队长期间收入合法的证明
且证据真是有效
那么与你的那个朋友有仇的村民可能会被认定为诽谤和侵害名誉权的行为

法院可以判决他赔偿损失或公开道歉

如果那个村民所说的“非法收入”不是指你朋友侵占了该村民的财产得来的，那么这类案子不属于民事案，也不属于刑事自诉案，他无权起诉。不过他可以报案，如果证据充足并达到犯罪程度，将由检察院起诉，而不是由哪个村民就可以起诉的。