公司劳务纠纷

我是今年的应届毕业生,在上海一家单位工作，合同是面试时签的，试用期从7月1日到9月30号，由于个人发展需要于9月19号向公司提出离职，但鉴于负责一个项目主要内容，故答应老板把项目负责到底再离开，也就是9月26号．老板做出承诺10月8号让我到公司结帐，结果是老板反悔说我违约，让我承担5000元的违约金．并拒绝付九月分工资．
备注：在9月5号左右，我收到一张公司的转正工资单，并通知我转正，（但工资单并未有我签字）．公司就以这个名义说我已经属于正式员工，提前解约属违约行为，让我承担违约金．并且说合同中有一条说签了合同就是认可了公司的＜人事管理制度＞，而公司的＜人事管理制度＞中规定说接收了转正工资单，就表示已经同意转正了．但这个＜人事管理制度＞我确是从未见过．我不知道这个条文在法律上合不合法，公司要我承担违约金合适吗，另外我能要回我9月份的薪水吗？
请大家帮帮我，特别是律师朋友啊，非常感谢，由于刚毕业，很多事情不明白不清楚，麻烦给予指点，非常感谢，万分感谢！

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