除真菌外的微生物都是原核生物吗?

no,一些原生动物门的生物有核，但还是微生物

错误。
病毒！

No，是微生物

除了病毒和真菌外，一般地，古菌类属于一个单独的分支，虽然从形态等方面和原核生物比较近，但从进化和基因的分析来看，一般不归入原核生物。
1楼的，既然叫原生动物，当然属于动物而不属于微生物，这个概念你搞混了。