用人单位拖欠劳动者工资应当加付工资的25%的补偿金，这个25%是指工资全额的25%，还是指拖欠部分的25%？

应该是全额的25%，即指拖欠部分的25%。

《违反和解除劳动合同的经济补偿办法》中第三条规定：

用人单位克扣或者无故拖欠劳动者工资的，以及拒不支付劳动者延长工作时间工资报酬的，除在规定的时间内全额支付劳动者工资报酬外，还需加发相当于工资报酬百分之二十五的经济补偿金。

全额的25%

这里说的是应付金额的25%，也就是说拖欠部分的25%.