原房主不配合办国土证怎么办

1、合理期限内（一般是买卖合同订立的90天内），可采用书面催告的方式，要求其协助办理产权证，可能的话最好采用挂号信的方式，并保留相关证据。
2、过了合理期限，可向法院提起诉讼，并出示书面催告的证据，要求对方履行合同，并赔偿由此造成的损失。

根据《中华人民共和国合同法》第八条 第六十条规定依法成立的合同，对当事人具有法律约束力。当事人应当按照约定履行自己的义务，不得擅自变更或者解除合同。依法成立的合同，受法律保护。
第九十三条 【合同约定解除】当事人协商一致，可以解除合同。
第一百零八条 【拒绝履行】当事人一方明确表示或者以自己的行为表明不履行合同义务的，对方可以在履行期限届满之前要求其承担违约责任。

根据<中华人民共和国城市房地产管理法>规定:“房产交易以在房产交易中心进行产权合法有效转移来确定产权的归属”。国家实行土地使用权和房屋所有权登记发证制度.第三十二条 房地产转让、抵押时，房屋的所有权和该房屋占用范围内的土地使用权同时转让、抵押。
基于你已与原房主进行了产权合法有效转移，并且办理了产权证，已经是该房产的合法产权人。但产权有瑕疵（土地证没进行合法过户）。所以根据以上国家法律法规规定,一、你可以要求原房主继续履行合同规定之义务.二、也可以要求原房主承担违约责任赔偿损失.三、到法院起诉。