工商所这样做合理合法吗

显然是不合法的，你们可以去基层人民法院提起行政诉讼
中华人民共和国行政诉讼法

第十一条 人民法院受理公民、法人和其他组织对下列具体行政行为不服提起的诉讼。

（一）对拘留、罚款、吊销许可证和执照、责令停产停业、没收财物等行政处罚不服的；

（二）对限制人身自由或者对财产的查封、扣押、冻结等行政强制措施不服的；

（三）认为行政机关侵犯法律规定的经营自主权的；

（四）认为符合法定条件申请行政机关颁发许可证和执照，行政机关拒绝颁发或者不答案复的；

（五）申请行政机关履行保护人身权、财产权的法定职责，行政机关拒绝履行或者不予答复的；

（六）认为行政机关没有依法发给抚恤金的；

（七）认为行政机关侵犯其他人身权、财产权的。

除前款规定外，人民法院受理法律、法规规定可以提起诉讼的其他行政案件。

你们可以去基层人民法院提起行政诉讼

那要看你们是否持有《工商营业执照》了，
如果有，他们明显不合法；
如果没有的话，他们是有权拿走你们的账本之类的。