PCR产物测序结果分析

首先你要有你目的产物和测序的DNA序列
再进入ncbi的网页http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
在网页最下端第二行有Align two sequences using BLAST (bl2seq) ，点击进入
看到有Sequence 1和Sequence 2，这里面分别输入你的PCR产物的序列和你测序的序列，最后点击Align，就会出现两个序列的对比结果。

关于怎样分析，怎样得到最大量的信息，怎样发现有意义的东西，这就是和你的课题有关系了。
比如说某人做的是突变，就需要分析哪些位点突变了，这些位点突变了影不影响氨基酸的变异，若是氨基酸变异了，对蛋白质的表达有什么影响和作用。等等

可能你得到的基因片段中有插入其他的序列。
你可以用得到的420BP的序列减去原来目的扩增的352bp的序列，再用这个序列去blast。
一基因被其他基因的插入其实发现的比较多的，最长见的是alu序列的插入。当然还有其他的转座子
如果你扩增的是癌基因，样本中多有这样的插入的话，这样的结果很有意义。

请问你PCR的模板是什么？
检测的目的片段又是什么？
把你测序得到的片段和目的片度对比看看差别，也把你的测序片断在ncbi上blast一下，看看是什么。

你去NCBI上做一个BLAST 看看相关信息
只有一个序列结果还出不来东西

测定亲缘关系
基因突变的检测