毕业生的档案问题

应该不会吧！你在这家公司上班一定有和他们订立劳动合同。只要你没有违背劳动合同的相关内容，他们没理由为难你。现在劳动者的权益有保障，如果有争议，可以诉诸法律。

看公司了,公司要不想放人的话,是不会让你转出去的

公司如果正规,那就不会有问题.
还有一个,一般现在私营企业没有人事权,而是委托一个人才服务机构,比如人才服务交流中心.私营公司在那里开一个户,这个公司的所有档案就可以放在那里了。
等你换工作的时候,你的人事关系只要公司出具解约或者离职证明,那基本上你就可以自由流动了.